国家微生物科学数据中心是2019年20个首批启动的国家级科学数据中心之一，微生物所为牵头单位，使我国微生物资源相关的一系列重要数据库进一步完善。于是，国家微生物科学数据中心和世界微生物数据中心牵头建立了全球微生物菌种保藏目录国际合作计划，搭建了全球微生物资源数据共享平台，汇聚了来自51个国家141家合作伙伴的52万株微生物实物资源数据，形成了全球互联互通的微生物数据信息化合作网络。